Allende suri presidendipalees 11. septembril 1973 riigipöörde ajal, mis tõi võimule kindral Augusto Pinocheti. Ametliku versiooni kohaselt laskis Allende ennast Fidel Castrolt kingiks saanud püssiga maha, kui presidendipaleed maalt ja õhust rünnati. Pinocheti režiim ei lubanud Allende perekonnal surnukeha pärast riigipööret näha, vahendas BNS.

Selle aasta algul algatati juurdlus presidendi surma põhjuse väljaselgitamiseks.