Arafat on olnud sisuliselt koduarestis oma Ramallah linna peakorteris, Muqatas, alates 2001 aasta detsembrist, mil Iisrael keelas tal Läänekaldalt lahkumise.

Ajaleht Haaretzi andmetel on Arafatil viimasel ajal olnud palavik, kurnatus ning muud gripi tunnused.

Arafati tervis on sedavõrd halb, et ta ei suutnud reedel lõpuni osaleda islami püha kuu Ramadani algusele pühendatud palvustel ega võtnud vastu õnnitlusdelegatsioone.

Arafati tervis on viimastel aastatel põhjustanud mitmeid spekulatsioone. Ta on sageli kasutanud „haigust” diplomaatilise vahendina, jättes osalemata kohtumistel, mis talle ebasobivad või väljendamaks oma protesti teatud sündmuste suhtes.

On olnud juhtumeid, kui ta on ise lekitanud lugusid oma halvast tervisest, et tekitada sümpaatiat ja kaastunnet enda suhtes.

Praegused teated tema kehvast tervisest tulevad ajal, mil Iisrael on ähvardanud Arafati kõrvaldada ja Euroopa üritab avaldada juutidele survet lubada Arafatil reisida Gazasse, kui ta on nõus osa oma võimu loovutama Palestiina peaminister Ahmed Qureiale.