MPEÕK sai mullu annetusi ja toetusi 4 561 661 krooni, sellest 521 136 krooni oli Eesti Kirikute Nõukogu eraldis. Eesti Kirikute Nõukogu eraldise suuruse summa ehk 521 136 krooni jagas kirik laiali oma kümnele kogudusele ning kolmele ühendusele - Püha Georgi sihtasutusele, MTÜ-le Fjodor Dostojevski nimeline preemia ning Püha Issidori kirjastusseltsile.

MPEÕK kulutas mullu 4,6 miljonit krooni ning kirik lõpetas aruandeaasta 110 597 krooniga miinuses. Kirikul oli aasta lõpu seisuga arvelduskontol raha 128.518 krooni ning kassas sularaha 26 143 krooni.

MPEÕK-i metropoliit Kornelius kirjutas majandusaasta aruandes, et kiriku tuludeks on nii kohustuslikud sissemaksed kui ka vabatahtlikud annetused. Eesti Kirikute Nõukogu eraldas 2009. aastal MPEÕK-ile rahalist toetust 521 136 krooni.

MPEÕK-i kulud moodustavad kantselei ruumide üüritasu Tallinnas aadressil Pikk 64-4 ja Pikk 64-2, elektri, telefoni, interneti ja valvesignalisatsiooni tasud, samuti transpordikulud ja komandeeringurahad. Igakuiselt eraldab MPEÕK metropoliit Korneliuse korraldusel 1200 krooni kohvi, tee, saiakeste ja muu sellise peale, mis maksustatakse kui erisoodustus.

Juunis 2007. avas kirik SEB pangas Lasnamäe Jumalaema kiriku ehituse jaoks konto annetuste kogumiseks. Mullu aasta lõpu seisuga oli annetuste arvel 1 943 995 krooni. Kiriku ehituse jaoks oli Moskvale alluv õigeusu kirik eelmise aasta lõpu seisuga maksnud 1 899 974 krooni.

Tööjõule kulutas MPEÕK mullu 1 156 758 krooni, mis läks üheksale inimesele töötasu maksmiseks. MPEÕK-ile alluvad kogudused tegutsevad iseseisvate mittetulundusühingutena.