Kirikute Nõukogu presidendina jätkab peapiiskop emeeritus Andres Põder (Eesti Evangeelne Luterlik Kirik) ning asepresidentidena pastor Meego Remmel (Eesti Evangeeliumi Kristlaste ja Baptistide Koguduste Liit) ja piiskop Philippe Jourdan (Rooma-Katoliku Kirik).

Sellises koosseisus on juhatus tegutsenud alates aprillist 2013. Piiskop Philippe Jourdan on olnud asepresident alates märtsist 2004.

Vastavalt Kirikute Nõukogu põhikirjale peavad nii president kui asepresidendid saama salajasel hääletusel kõigi hääletamises osalenud liikmeskirikute üksmeelse toetuse.

Tänases hääletuses osalesid Eesti Kirikute Nõukogu kõigi 10 liikmeskiriku esindajad.