Flynn, kes toetab moslemitele sissesõidukeelu kehtestamist, kirjeldas tänavu suvel „kultuuri kaitsmisega tegeleva julgeolekuorganisatsiooni“ ACT for America konverentsil islamit kui vähkkasvajat. Tulevase rahvusliku julgeoleku nõuniku hinnangul on käimas „kolmas maailmasõda“ radikaalse islami vastu, mida ta peab „totalitaarseks ideoloogiaks“, vahendab uudistekanal ABC.

Erukindral tõdes usutluses mullu uudistekanalile Al Jazeera, et moslemitele sissesõidukeelu kehtestamine tõenäoliselt siiski „ei töötaks“, mistõttu tuleks tema meelest senisest veelgi põhjalikumalt uurida Süüriast ja teistest kõrge terroriohuga riikidest saabuvate inimeste tausta.

Veebruaris märkis ta oma Twitteri kontol, et „moslemite kartmine on ratsionaalne“.

Ühtlasi nimetas ta vasakpoolsete vaadetega senaator Bernie Sandersit „vankumatuks kommunistiks“.

Flynnil ei ole vaja senati heakskiitu, asumaks tööle riigipea rahvusliku julgeoleku nõunikuna.