Jüri Kadak osales alates 1990. a. rahvuslikus taasiseseisvusprotsessis, organiseeris ohvitseride löögirühma ja 1991. a. võttis osa Toompea kaitsest. 1991. a. oli Kalitseliidu liige ja Harju Kaitseliidu Maleva staabiülem. 1992 – 1997 oli Eesti Kaitseväe tegevteenistuses. sh 1994 aastani Kaitseliidu peastaabi ülema asetäitja – operatiivosakonna ülem; 1992 - 1993 täitis Eesti Kaitseliidu ülema kohuseid. 1994 – 1997.a. teenistuse lõpuni Kaitsejõudude Peastaabi ülema asetäitja – operatiivosakonna ülemana. 1994 – 1995 Eesti Vabariigi kriisikomisjoni liige.

Peale tegevteenistuse lõppu Jüri Kadak panustas välis- ja julgeolekupoliitika alaste teadmiste arendamisse õppejõuna nii Eestis kui välisriikides, samuti jagades oma kogemust rahvusvaheliste suhete ja julgeolekueksperdina nii Eesti kui välisriikides.

Kadak avaldas sadakond teadusartiklit ja arvamusartikleid nii eesti-, inglis- kui ka venekeelsetes teadusväljaannetes ning toimetas erialaseid raamatuid. Juhendanud hulgaliselt bakalaureuse- ja magistritöid. Kevadel 2018 ilmus Jüri Kadaku raamat „Teine okupatsioon. Algus ja lõpp”.

Kadakut jäävad mälestama abikaasa ja 2 tütart.